沈阳公司进行内部审计时，需要准备以下资料：

账务资料：

审计期间的会计报表及附注（包括年报主表、附表和报表附注，以及季报、月报表）。

全部账目。

全部会计凭证。

科目余额表（内审期间各年1级至末级的期初、期末和累计发生额）。

银行存款对账单、余额调节表（内审期间各年所有账户的银行存款对账单和审计期末银行存款余额调节表）。

固定资产及无形资产产权证明（如房屋、车辆等）。

长短期投资的相关文件，包括投资协议、被投资单位营业执照和会计报表。

长短期借款合同和抵押担保资料。

固定资产和存货盘点表。

纳税申报表、缴款书、税务检查报告。

所有往来明细（包括应收（付）账款、预收（付）账款、其他应收（付）账款）。

收支明细表（内审期间各年的主营业务和其他业务收支明细）。

费用明细表（内审期间各年的管理费用、经营费用、财务费用明细）。

支票和发票的使用情况表。

备查资料：

营业执照。

税务登记证（国、地税）。

组织机构代码证书。

纳税鉴定文件（国、地税）。

公司章程、协议（工商备案）。

设立、变更验资报告。

以前年度的审计报告和资产评估报告。

这些资料能够帮助内部审计机构全面了解公司的财务状况和业务运营，确保审计的准确性和完整性。