日本留学时，如果需要办理海牙认证，通常是针对学历证明、成绩单等教育相关文件。根据我查找到的信息，日本学历证明的海牙认证流程如下：

准备材料：首先，需要准备好日本学历证明的扫描件或原件，包括学位证书、成绩单等。

公证：然后，将这些学历证明提交给日本的公证役场或公证人进行公证。公证是对当事人意思表示或事实的证明行为，经过公证的文件具有更高的法律效力。

海牙认证：公证完成后，将公证过的学历证明提交给日本外务省或海牙认证办公室办理海牙认证（Apostille）。这个过程可能需要20个工作日左右，如果有紧急需求，可以选择加急办理，一般需要10个工作日左右。

需要注意的是，中国已于2023年3月8日正式加入《取消外国公文书认证要求的公约》（即《海牙公约》），并在同年11月7日正式生效实施。这意味着，从那时起，中国公民办理海牙认证的流程变得更加简便，文书在成员国之间流转只需办理海牙认证即可。

对于日本留学的海牙认证，主要是针对学历证明等教育相关文件，需要经过公证和海牙认证两个步骤。同时，由于中国已经加入了《海牙公约》，这使得海牙认证的办理变得更加便捷。